PCB电路板一般而言会分成六层，具体为：机械层、禁止布线层、阻焊层、助焊层、丝印层和过孔层。

机械层：

Protel99SE提供了16个机械层，它一般用于设置电路板的外形尺寸，数据标记，对齐标记，装配说明以及其它的机械信息。这些信息因设计公司或PCB制造厂的要求而有所不同。执行菜单命令Design|MechanicalLayer能为电路板设置更多的机械层。另外，机械层可以附加在其它层上一起输出显示。

禁止布线层：

用于定义在电路板上能够有效放置元件和布线的区域。在该层绘制一个封闭区域作为布线有效区，在该区域外是不能自动布局和布线的。

阻焊层：

在焊盘以外的各部位涂覆一层涂料，如防焊漆，用于阻止这些部位上锡。阻焊层用于在设计过程中匹配焊盘，是自动产生的。

助焊层：

助焊层是机器贴片时要用的，是对应所有贴片元件的焊盘的，大小与顶层/底层一样，是用来开钢网漏锡用的。

丝印层：

丝印层主要用于放置印制信息，如元件的轮廓和标注，各种注释字符等。Protel99SE提供了TopOverlay和BottomOverlay两个丝印层。一般，各种标注字符都在顶层丝印层，底层丝印层可关闭。

钻孔层：

钻孔层提供电路板制造过程中的钻孔信息（如焊盘，过孔就需要钻孔）。Protel99SE提供了Drillgride（钻孔指示图）和Drilldrawing（钻孔图）两个钻孔层。

PCB电路板现在主要发展方向也是小而精密，工作人员对每一块电路板都要认真对待，才能为广大用户提供更加精巧的PCB电路板。